Para consolidação destas linhas de pesquisa existem os seguintes laboratórios:
Laboratório de ciência do trabalho e colheita da madeira
Laboratório de silvicultura
Laboratório de áreas degradadas
Laboratório de proteção florestal
Laboratório de colheita da madeira e oficinas
Laboratório de genética e melhoramento florestal
Laboratório de fisiologia
Laboratório de ecologia
Laboratório de sementes