O Coordenador, Vice-coordenador e Colegiado do Curso de pós-graduação é regido institucionalmente pela Resolução 65/09-CEPE de 11 de julho de 2003 do Conselho de Ensino, Pesquisa e Extensão (CEPE), colegiado superior da UFPR. Esta resolução normatiza o Sistema de Pós-Graduação da UFPR e estabelece critérios de gerenciamento dos cursos delegando poderes para estabelecer o Regimento do Programa de Pós-Graduação em Engenharia Florestal para alunos que ingressaram no curso até março de 2010 (aprovado pelo Colegiado em 08 de dezembro de 2003). Novo Regimento do Programa de Pós-Graduação em Engenharia Florestal para alunos que ingressaram no curso após 09 de abril de 2010. (atual em vigência aprovado pelo Colegiado em 09 de abril de 2010). O pós-doutorado tem como orientação a Resolução do Pós-Doutorado, aprovado em 24 de setembro de 2004, pelo Conselho de Ensino Pesquisa e Extensão Universitário da UFPR.