O programa de pós-doutorado é administrado pelo Coordenador e Vice-coordenador e tem como fórum consultivo e deliberativo o Colegiado do Curso, no caso do mestrado e doutorado. O processo administrativo e a organização do curso fica a cargo da Secretaria do Curso. O pós-doutorado é conduzido por um Colegiado Diretivo, de acordo com seu processo de criação.